1.加重高血压
咖啡因本身具有止痛作用，经常与其他简单的止痛剂合成复方。但是，长期大量服用咖啡因会加剧高血压。咖啡因可以使血压上升，如果情绪紧张，效果会更加危险。因此，高血压的人最好在工作压力大的时候避免饮用含咖啡因的饮料。
一些长期饮用咖啡的人可能认为自己对咖啡因已经免疫，然而事实并非如此。研究显示，喝一杯咖啡后，血压升高的影响可以持续长达12小时。
2.促生骨质疏松
咖啡因具有利尿效果，长期大量饮用咖啡可能导致骨质流失，对骨骼健康有不利影响。尤其对于妇女来说，可能会增加骨质疏松的风险。
然而，这要建立在食物中缺乏足够钙摄取或缺乏运动的基础上，对更年期的女性来说，可能由于雌激素缺乏导致的钙流失也是一个因素。在上述情况下，加上大量咖啡因才可能对骨骼构成威胁。如果我们能合理饮用咖啡，并保持适当的摄入量，就能避免因咖啡而放弃其他健康饮食。
3.过度刺激神经
咖啡因有助于提高警觉性、灵敏性、记忆力和专注力，在焦虑时会感觉有所帮助。但是，如果饮用过量的咖啡，就会产生像食用同等剂量的兴奋剂一样的效果，会导致神经过敏。
对于倾向焦虑失调的人来说，咖啡因会加重手心冒汗、心悸和耳鸣等症状。