月经周期通常分为月经期、排卵期和黄体期。在月经期，子宫内膜脱落，伴随出血，持续3-7天左右。排卵期在月经周期的中间，大约在月经结束后的第14天左右。黄体期是排卵后至下一次月经来临之间的时间段。
受孕通常发生在排卵期，因为这是卵子释放到输卵管的时间。卵子在输卵管中存活大约12-24小时。精子可以在女性体内存活3-5天。因此，如果在排卵期同房，精子可以在卵子释放后的几天内受精，从而导致怀孕。
根据上述生理周期，月经结束后的第三天同房通常不会导致怀孕。因为在这段时间内，通常处于月经期的末尾，卵子还没有开始发育和释放。然而，每个女性的生理周期可能略有不同，排卵期的准确时间也会有所变化。
虽然月经结束后的第三天同房通常不会导致怀孕，但如果女性的生理周期较短，排卵期可能会提前。此外，精子在体内存活的时间也可能因个体差异而有所不同。因此，为了避免意外怀孕，最好在无保护性行为时采取措施。
总的来说，月经结束后的第三天同房通常不会导致怀孕，因为这时通常处于月经周期的末尾，卵子尚未发育和释放。然而，由于个体差异，生理周期可能有所变化，因此为了避免意外怀孕，最好在无保护性行为时采取措施。