三九贴和三伏贴目前药物成分基本类似，均含有温热或温经散寒的助阳药物，但存在以下区别：
一、三伏贴：
1、三伏贴是在头伏、中伏和末伏的第一天使用。
2、三伏贴的效果是在夏季治疗冬季疾病。
3、在阳气最盛的时候使用，最初使用三伏贴，因为在这段时间外界的阳气最盛，此时贴敷阳热药物于人体的特定穴位，可以最大限度地吸收这些助阳成分，借助自然界的阳气。
4、主要用于治疗因体内寒气过剩或阳气不足而引起的特定疾病，例如老年人慢性支气管炎、哮喘、关节痛、胃寒引起的脾胃病等。这是最典型的冬病夏治方式。
二、三九贴：
1、三九贴是在冬至日开始数九天，然后继续往后数九天，分别为二九和三九。
2、三九贴的效果是在冬季治疗夏季疾病。
3、在阴气最盛的时候使用，部分医生会将三九贴用作补充三伏贴的办法。三九贴是在三九天，即自然界阴气最盛的时候，将一些助阳的药物贴敷于人体，这样可以促进人体对阴寒的排泄，或增强人体抵抗阴寒的能力。
4、用于治疗因阴寒过盛或阳气不足而发作的疾病，例如老年人慢性支气管炎、关节痛、老寒腿等。
三九贴和三伏贴都是一种贴敷治疗的方法。两者的药物组成基本上没有太大区别，但成分比例方面存在一些差异。综合来看，三伏贴的治疗适应范围更广泛。
如果人体有热性的表现，例如发热或急性炎症，出现流黄鼻涕、咳黄痰或其他炎症性表现，即中医中属于热症的情况，一般不建议使用三伏贴或三九贴，因为可能会加重热性疾病的症状。