在两人都感染了同一种传染病的情况下，通常建议避免同房，以减少病毒或细菌的传播风险。
传染病可能通过密切接触、空气传播或体液传播进行传染。在同房过程中，接触面积广、密切程度高，容易增加传染的可能性。
即使是已经发生过感染并且在治疗中的夫妻或伴侣，也应该在医生建议下才能决定是否继续同房。某些传染病可能在感染后仍然具有传播性。
另外，即使症状已经消退，某些传染病的潜伏期也可能很长，期间仍有传染性。因此，不应轻易忽视这一问题。
如果两人确实需要继续同房，应该采取以下预防措施：
1. 确保房间通风良好，保持空气流通。
2. 使用避孕套等防护措施，减少体液传播的风险。
3. 注意个人卫生，经常洗手，尤其是在接触可能受感染物品或区域后。
4. 避免亲密接触时的口腔交换、共用餐具等行为，以减少口腔和消化道传播的可能性。
5. 如果有条件，可以选择暂时分开居住，直到双方都没有传染性为止。
总之，在处理两人都感染同一种传染病的情况时，健康和安全应始终是首要考虑因素。遵循医生的建议，采取适当的预防措施，有助于减少传播风险，保障双方及他人的健康。